Pobożność
Przez wiele lat wysłuchanymi modlitwami słynął wizerunek Matki Boskiej Bolesnej znajdujący się w ołtarzu o tym samym tytule. To najstarszy obraz w archikatedrze kowieńskiej. Zawieszone po obu jego stronach wota świadczą o uproszonych łaskach. Do dzisiaj niektórzy pielgrzymi w geście pokuty obchodzą na kolanach filar, w którym wbudowano ołtarz Matki Bolesnej. Uroczystość Matki Boskiej Bolesnej przypada w piątek przed Niedzielą Męki Pańskiej (tzw. Palmową). Głoszone w ostatnich latach kazania rekolekcyjne ożywić mają tradycję uroczystego obchodzenia tego dnia, który w okresie międzywojennym gromadził tłumy wiernych. W okresie komunizmu, w akcie modlitwy i zawierzenia Bogu, ołtarz często obchodziły na kolanach matki, żony, córki i siostry zesłańców i partyzantów.
Łaskami słynie także obraz Matki Łaskawej, znajdujący się w archikatedrze od 2001 r., a wcześniej – w osobnej kaplicy bernardyńskiego kościoła św. Jerzego Męczennika. Dokumenty z archiwum konwentu bernardynów w Kownie zawierają świadectwa o cudowności tego wizerunku. Zachowało się źródło, w którym spisano doznane w latach 1669-1706 łaski, w większości cudowne uzdrowienia. O wyproszonych przed tym obrazem łaskach świadczą także wymienione w tym samym dokumencie wota.
Od 2005 r. w kaplicy Najświętszego Sakramentu w archikatedrze trwa wieczysta adoracja. Odmawia się tam Liturgię Godzin, różaniec oraz Koronkę do Miłosierdzia Bożego.